与此同时，星河议会的文明联军赶到，不同维度的科技与魔法交织成防御网，暂时阻挡住了神秘人的攻势。银发女性的后人带来了星渊守望者的终极武器——“星穹棱镜”，这台装置能将文明联军的力量聚焦成维度切割光束。
苏夏的意识引导着联军的能量，在关键时刻，林晓棠的突击队找到了虚熵陷阱的漏洞。他们利用量子纠缠原理，将攻击的能量导向宇宙空洞，避免了能量反噬。星穹棱镜发射的光束击中神秘人的实体锚点，暗紫色的防护罩出现裂痕。
神秘人恼羞成怒，强行加速遗迹破解。创世纪遗迹的封印轰然破碎，宇宙诞生时的原始代码如洪水般涌出。这些代码蕴含着强大的混沌力量，接触到的物质开始随机重组，有的恒星变成了巨大的水晶，有的行星化作流动的液态金属。
“不能让代码扩散！”苏夏的意识全力运转“文明火种”系统，试图将代码重新封印。但原始代码的力量太过强大，系统开始出现过载。危急时刻，各个文明的代表挺身而出，他们将自己文明的核心数据与“文明火种”融合，形成了一道由信念与智慧构成的防火墙。
林晓棠带领突击队冲向神秘人，在近身搏斗中，她发现神秘人的神经接口连接着一个记忆芯片。读取芯片内容后，众人震惊地得知，神秘人竟是遗落之民的最后幸存者。在熵寂回响失败后，他陷入了对文明存在意义的怀疑，认为只有回归宇宙最初的混沌状态，才能终结一切纷争。
“你错了！”林晓棠将芯片插入星耀号的主控系统，把全宇宙文明交流、合作的影像投射到神秘人面前，“文明的价值，在于多样性碰撞产生的火花。”苏夏的意识也化作金色的人形虚影，与林晓棠并肩而立：“看看这些光芒，它们因守护而汇聚，因理解而永恒。”
神秘人沉默许久，最终摘下神经接口，身体的暗紫色纹路逐渐消退。他抬手一挥，星辰镰刀化作万千星光，将扩散的原始代码重新凝聚。创世纪遗迹自动修复，宇宙恢复了平静。
这场危机过后，星河议会建立了“文明思辨所”，专门探讨文明发展的哲学问题。苏夏