“请罪书”中，林远山以家主身份，代表“回春堂”及林家，对“安神散”中添加未明示的曼陀罗花粉、朱砂等有害成分，导致众多百姓受害之事，表示“痛心疾首，悔恨无及”，承认“治家不严，管教无方，致使逆子林琅为牟私利，欺上瞒下，铸此大错”，并“自愿承担一切罪责”。书中避重就轻，将主要罪责推到已被收押的林琅身上，并称“其余诸事（如下毒、勾结邪教等），皆为不实诬陷，恳请官府明察”，但姿态放得极低。
“赔偿方案”则颇为具体：一，林家愿拿出五十万两白银，设立“安神散受害救助基金”，用于赔偿所有登记在册的受害者。根据受害程度，分为“重症”（赔偿五百两）、“中症”（三百两）、“轻症”（一百两）三档，由官府、太医院及受害者代表共同核定发放。二，林家愿承担“济世堂”义诊处至今的所有药材及诊疗费用，并追加捐赠五万两，用于后续救治。三，林家承诺，永久下架并销毁所有“安神散”及其相关配方，永不再生产销售。四，林家愿公开“回春堂”近十年所有药材账目，接受官府与同行查验，以证“其余药材清白”。五，林远山自请削去“回春堂”总掌柜及林家一切商事职务，闭门思过。林琅之罪，交由国法严惩，林家绝无异议。
同时，被“保护”在府中“养病”多日的刘副院判，也在“病愈”后，被刑部官员“请”去问话。这一次，他“如实”交代了收受林家贿赂、在“安神散”备案中徇私舞弊的经过，但坚称对“安神散”后期私自加大剂量、以及林家其他不法之事“毫不知情”，将所有罪责都推到已死的“中间人”和林琅个人身上。这份口供，虽不尽不实，但至少坐实了“安神散”备案造假和林家行贿官员的罪名，对曹公公和其他可能的保护伞，则巧妙地避开了。
林家的公开请罪和巨额赔偿方案，如同投入滚油中的冰块，瞬间引起了轩然大波。
京兆尹衙门不敢怠慢，立刻将“请罪书”和“赔偿方案”呈报府尹，并抄送刑部、都察院。府尹会同刑部、都察院官员紧急商议，认为林家此举虽是无奈之举，但态度还算“诚恳”，赔偿方案也算“有诚意”，且涉及金额巨大，受害者人数众多，若一味严惩，