皇甫嵩最终还是惧怕贸然起兵讨董失败，会被掌控朝廷的董卓批判为反贼，皇甫氏几代忠名有损；并且选择了忠于天子刘协，带上儿子皇甫坚寿，奉诏入京。
但皇甫嵩临行前还是对关中防务做了调整：派侄子皇甫郦领兵一万五千，驻守陈仓；京兆尹盖勋领兵三万，驻守长安城；郑县、槐里、茂陵、蓝田、霸陵、杜陵、万年等重要城池，均布置了四五千人驻守；其余城池、小邑，也分遣一二千人驻守；另派梁衍率军一万驻守华阴。
皇甫嵩嘱咐三人，面对凉军的大举进攻，务必坚守不出，坚持到董旻率军赶到，驻扎在最东的华阴的梁衍，才可合兵董旻，一同反攻凉军。