《沉默的荣耀》讲的是吴石在果军大败退后，临危受命成为国防部次长，协助光头制定各战场的防守计划。
吴石通过传递情报或者制定有利于解放军进攻的作战计划等方式，帮助解放军成功击溃果军防线。
吴石本来可以留在大陆，但是为了获得更多的情报，不顾生死决定去岛上潜伏。他的副官聂曦，为了帮助自己的老师，毅然同行。
为了建立交通线，在香江红色企业工作的朱枫受组织派遣上岛担任吴石的单线交通员。
在岛上，吴石成功传递了金门、舟山的防御情报，以及岛上兵力、舰队、气象洋流等各种情报口当叛徒蔡孝干被抓后，吴石等人面临暴露风险。吴石在危急关头，不忘签署特别通行证送朱枫离岛。
可惜，朱枫在距离大陆咫尺之遥的舟山被抓。在被捕时刻，朱枫为了保住秘密，和著热水将金链子和手镯分四次吞入肚中，可惜未能如愿，最终在马场町与吴石、聂曦、陈宝仓等人一同被枪杀。
《沉默的荣耀》在基于历史事实的基础上，对部分情节做了改编。
徐桑楚认为这部电影要拍的话，战争场面必然要调动部队，只有调动部队才能把战争的场面拍好。
调动部队对于八一厂来说轻而易举，但是对于民霖影业来说，就困难了。
「至于经费倒在其次，我看了剧本，大部分剧情都是在室内完成，这并不费什么钱。简单算了一下，最多不会超过三百万人民币，还没《太极张三丰》多，但是拍好了，票房一定比《太极张三丰》高。」
《太极张三丰》一大半的经费花在了导演和演员上，《沉默的荣耀》用大陆导演和演员就花不了那么多钱。
「能过亿吗？」刘一民问道。
徐桑楚肯定地说道：「拍得好的话，肯定能。这部电影肯定不会赔，票房至少在四千万以上。」
「两亿呢？」
徐桑楚笑道：「你干脆将我给卖了，看看有没有两个亿。」
「哈哈哈！徐厂，你觉得咱们自己拍怎么样？您身为沪影厂的厂长，去跟部队谈一谈合作，应该不是难事吧？」刘一民问道。
徐桑楚沉吟片刻后，自信地说道：「以我的面子，倒也不算是什么难事。但肯定要比八一厂出面，稍微难那么一点。」
以前沪影厂拍戏的时候，也没少找部队帮忙。徐桑楚怕的是今非昔比，他虽然还是厂长，但已经不是国营厂的厂长了。
「加上我的面子呢？我在总政应该也有几分薄