庚子（初三），韩宜妃孕，上亲祀夜明于夕月坛。
户部侍郎范应期请移驾南巡。
下廷议，无果。
癸卯（初六），以三年考满上，改云南新化直隶州知州孙继皋、四川参议顾宪成，除为翰林院修撰，兼中书舍人，值南京行在；以三年考满中上，升广东肇庆府同知余孟麟，为惠州府知府。
原职以中书舍人王应选、姚三让、张一坤按序补阙。
甲辰（初七），蒙古顺义王病笃，奏请修筑寺庙、汉城以祈福延寿，永安公主忠顺夫人朱轩姬附奏。
下廷议，乃赐水泥、木料等建材若干，赐寺名曰大召，赐城名曰呼和浩特，遣弘法等高僧三名，出关传经。
又以六年考满上，升右副都御使、兵部左侍郎、总督宣大陈栋，为右都御史、兵部尚书，总督三边，辖制陕、甘、宁、延，节制宣大，驻花马池。
乙巳（初八），以辽镇将领招过女真降夷，下旨李成梁、杨五典等各赏银有差，赐降夷张猳为建州左卫指挥佥事。
命辽东总兵李成梁子如松，充五军都督府大元帅近卫，例推用。
丁未（初十），遣礼部尚书汪宗伊祭先师孔子，该年不予衍圣公祭赏。
以六年考满，升右副都御史总督漕运王宗沐，为右都御史、兵部左侍郎，总督辽东；改太仆寺卿蔡汝贤，为辽东巡按御史。
右副都御史顺天巡抚胡执礼，补阙漕运总督；五军都督府参谋御史郑宗学，补阙太仆寺卿。
癸丑（十六），上遣文武群臣，祭宋丞相文天祥。
礼部侍郎何洛文、林士章，刑部侍郎许国，请移驾南巡。
下廷议，无果。
甲寅（十七），万寿圣节，上御皇极殿，文武百官行庆贺礼，天下各王府及文武各衙门，进庆贺表。
该日，户部奏，以各省直清丈，多有未行册报，及议处未尽者，议行各抚按查核以报。
五军都督府奏，按例调京营神机营总兵焦泽，率战兵四营、车兵一营，合一万五千人，与南京兵备换防操练。
上是之。
户部尚书王国光、兵部尚书殷正茂、礼部尚书汪宗伊，奏请南巡。
下廷议，无果。
戊午（二十一），磔河南妖逆曹仑、王迁善、杨廷友于市而斩吉廷有等十二人，以左道妖术，倡乱犯仪，挑拨民乱，冲撞衙署。
诏河南、浙江、江西三省按察使，回京听勘。
除司经局洗马李长春，为江西按察使；升国子监祭酒赵志皋，为河南按察使；起用