2月初1日，李氏朝鲜郡王在与满清将领们商谈好事情后，就和李氏朝鲜文武百官们一起返回了京畿右道汉城府王京，刚一回生李氏朝鲜郡王就下令把李氏朝鲜八道都元帅：金自点、李氏朝鲜三道都元帅：沈器远，这两人罢免职位抓入刑曹监狱。
并对金自点与沈器远，两人施以绝岛定配的处分，将金自点流放到全罗右道珍岛郡，沈器远流放到江原岭西道春川都护府，但是司谏院、司宪府却不断要求处死金自点、沈器远，而李氏朝鲜郡王却看他们都是反正功臣，且罪不至死的份上都不予批准。
2月初2日，满清太宗：爱新觉罗·皇太极，班师回朝，仅留下满清正红旗贝子：爱新觉罗·硕讬，以及满清都元帅：孔有德、满清水师总兵：耿仲明、满清金州卫总兵：尚可喜，驻守李氏朝鲜义州府准备攻打皮岛。
满清太宗虽然在班师途中，曾下令勿得劫掠李氏朝鲜降民，但满蒙大军们撤退时依旧有抢掠之患。
不仅如此满蒙大军撤走时，还带走了作为人质的李氏朝鲜昭显世子：李溰、王二子李氏朝鲜凤林大君：李淏，以及约50万的李氏朝鲜俘虏回国，还包括力主斥和的李氏朝鲜司宪府掌令：洪翼汉、李氏朝鲜弘文馆校理：尹集、李氏朝鲜弘文馆修撰：吴达济，三位也被带到大清帝国盛京城内处死！
3月初1日，穿过海风大潮的明军水师援军，刚到达黄海右道海域被李氏朝鲜渔民们发现，连忙告知李氏朝鲜郡王归降满清胡虏鞑子的事，这才让明沿海总兵：陈洪范、明东江总镇总兵：沈世魁，得知大明附属国李氏朝鲜王国已降清！
只得派使者前去京畿右道汉城府王京问候一下，李氏朝鲜郡王含泪写下私信交由明使带回，最终水师明军只得返回大明帝国。
而李氏朝鲜郡王在此后也尽可能的顺从满清之意，对耻于向满清称臣的大臣们则深恶痛绝，他认为所受之辱都是斥和派们造成的，还大骂斥和派误国。
又说道“朝鲜语：此辈（指斥和派）以国之存亡置之度外，谋占美名，党同伐异，竟使宗国覆没，甚可恶也！”
与之相应的则是重用主和派和亲清派，并且在丙子胡乱后还加封李氏朝鲜吏曹判书：崔鸣吉，为［领议政］。
也因此李氏朝鲜郡王的政权合法性，也在两次胡乱后面临严重危机，由于李氏朝鲜郡王反正本身的名