朝廷当即下令派出北镇抚司锦衣卫缇骑，前去山海卫逮捕王化贞，又罢免了熊廷弼的辽东总镇经略官职，让他听候审问。
正月29日，明熹宗传谕兵部加强戒备，又让其亲军二十六卫之一的北镇抚司锦衣卫、东厂锦衣卫，分别严缉京城间谍，并且下令禁止居民燃放鞭炮，以此断绝传递消息。
2月初3日，明水西宣抚使司同知：安邦彦，率军2万人借口朝廷征兵支援辽东都指挥使司为由，发动袭击并在刚刚叛变的明乌撒军民府知府：安效良，以及乌撒卫驻军的协助下，攻占毕节攻破了毕节卫拿下七星关守御千户所。
致使云南承宣布政使司乌撒后守御千户所治下的明沾益州知州夫人：设科，也纠集明乌撒后守御千户：普胙，等人起兵作乱。
当然作为与四川承宣布政使司东川军民府、乌撒后守御千户所沾益州有姻亲关系的云南承宣布政使司武定军民府知府：张世臣，便与明沾益州知州夫人遥相呼应。
叛军乌撒军民府知府：安效良，也一同南下兵援贼兵，致使云南承宣布政使司曲靖军民府全境沦陷，而寻甸府也岌岌可危！其表现出的凶悍就不难理解了。
就连贵州承宣布政使司贵阳府洪边州等地土官也纷纷响应造反。
三路叛军们先后分兵攻陷了贵州宣慰使司安顺州、毕节卫、平坝卫、龙里卫、平越卫、镇远府偏桥卫、普安州、安南卫、思州府、兴隆卫、都均府、威清卫、镇康州、云南承宣布政使司曲靖府沾益州，湖广承宣布政使司辰州府沅州，等地，彻底切断了明军救援路线以及滇黔通路。
几乎打穿了整个贵州承宣布政使司地界，消息传出去之后，云南承宣布政使司、四川承宣布政使司、贵州承宣布政使司、湖广承宣布政使司，四个布政使司衙门均震惊，连忙召集官员商讨会议，并上奏朝廷请求调派大军镇压。