这让明东阁大学士难以忍受这种诬陷，急于争辩道“若召藩王，须得用金牌信符，遣人必有马牌，由内府兵部可验之。”
言辞激昂壮烈。
于是北镇抚司锦衣卫队就逮捕了明兵部车驾清吏司主事：沈敬，进行讯问，确实没有动用过金牌、信符，的证据，但明武功伯仍判于谦和王文两人阴谋未遂，继续被关押在大理寺中。
而被夺官职的于谦大笑着，说道“这是石亨他们诬告你的意思罢了，辩解又有什么用呢？”
可待审判奏折上呈过后，明英宗还有些犹豫，虽然之前京师保卫战中于谦曾不让自己入京，可那毕竟也是不得已而为之！便有些叹息的说道“王卿可以斩，可于卿乃是有功之臣，这样平白无故杀之，恐怕不好吧？况且当初京师保卫战以及抗击北虏之时，确实保住了大明半壁江山社稷，如今却…。”
不曾想此话立马被明武功伯给打断，还进言道“不杀于谦，那陛下您复辟这件事，就成了出师无名的了！”
因此才让明英宗的主意改变。
正月23日，在大理寺狱中的于谦与王文两人被押往外城崇文门外，就在这座他曾经拼死保卫的城门前，得到了他最后的结局～斩决，史称“〈阴霾四合天下怨之，京郊妇孺无不泣洒。”
但是明遂溪县教谕：吾豫，却趁机上奏朝廷说道“像于谦这样的罪应该灭族，于谦所推荐的各部文武大臣们都应该处死。”
最后在刑部坚持原判上，这才停止了杀戮，由明北镇抚司锦衣卫千户：白琦，请求写上他的罪行，刻板印刷在全国公布，一时要讨好皇帝争取宠幸的人，全都以于谦作为一个话柄。
2月初1日，明英宗经过一番处理之后，这才想起来废明代宗：朱祁钰，为「郕亲王」迁之西苑内，还贬明代宗生母皇太后：吴氏，复为「宣庙贤妃」、又废明汪皇后，复为「郕亲王妃」、还削明孝肃杭皇后谥号，为「孝肃杭侧妃」、改明怀献太子：朱见济，为〈怀献世子〉，皆称为皇太后制行之。
接着又有明礼部右侍郎：汤序，奏请皇帝陛下革除景泰年号，被明英宗拒绝未允。
到了2月19日，被幽禁在西苑的明郕亲王：朱祁钰，归西而去，皇哥明英宗下诏丧葬悉依亲王例，毁其所营造的「寿陵」，葬在西山，谥号〈郕戾亲