蒋介石能够容纳孙科，一来孙科是孙中山的长子，其次，孙科也有一定的能力，最后，蒋介石容纳他，还能让自己留下一个好名声。
三、晚年归宿
尽管孙科兢兢业业为蒋介石做事，但他内心里却一直对蒋介石不满，总是在寻找机会绊倒蒋介石。机会终于来了。
解放战争爆发之后，随着解放军反攻的开展，国民党一路溃败。此时的孙科见有机可趁，于是采取种种措施逼迫蒋介石下野。
1948年3月底，南京国民党政府举行总统、副总统选举。
总统人选毫无悬念，非老蒋莫属。
副总统之位虚位以待，李宗仁、程潜、于右任、莫德惠、徐傅霖等人都跃跃欲试。
眼看着桂系有一家独大的趋势，老蒋很忌惮这一点，想让李宗仁主动放弃竞选。
李宗仁也不是吃素的。25岁就取代陆荣廷成为桂系“广西王”的李宗仁戎马一生，战功赫赫的他素有问鼎中原之志，当然不肯仰人鼻息。
被拒绝的老蒋在无奈之下只好扶植看起来比较好控制的孙科上台，期待孙科击败李宗仁，成为他的傀儡。
老蒋为了与李宗仁抗衡，甚至通过王世杰私下向胡适透露希望胡适竞选总统的愿望。
胡适一介文人，乍一听，心动不已，不过思前想后，和老妻江冬秀商量之后还是决定不掺和这事。
这样一来，老蒋只能把宝全都押在孙科身上了，为了让孙科与自己同进退，他还让夫人宋美龄亲自出马去劝孙科参加选举。
孙科原本也无意于去竞选一个傀儡般的副总统。但是就看来宋美龄和宋庆龄这层关系上，他也得给几分薄面，出个场，凑个数。
虽然孙科认为自己是凑数的，但老蒋对这件事却很上心，他命令军统上下倾尽全力，助力孙科竞选。
李宗仁也不甘示弱，为了战胜孙科，为争得选票，对“国大代表”们极其“亲切”。
4月19日，老蒋以2430票当选，陪选的国民党元老居正得票269。
23日，副总统竞选进行首轮投票。
只要超过1523票，就能当选，不过六位竞选人均未过半，李宗仁票数最多，754票，孙科其次，559票。
第二轮PK，李宗仁得1163票、孙科得945票、程潜得616票，仍然没有人票数超过一