与此同时，后任内阁大学士北京人方从哲、给事中姚永济、郭尚宾等人继续上疏弹劾。万历皇帝只是批示“高寀事知道了”，想不了了之。
7月3日叶向高第三次上疏，继续弹劾高寀。7月31日叶向高第四次上疏。万历没有办法只得要求高寀回京。
然而高寀却以各种理由拖延，福州府官员为此驱逐。他10月9日才启程，但由于东西太多，以每天三十里的速度回到京城。到北京后，仍然飞扬跋扈。
不过，由于高寀临走也要捞一笔的爱好，导致广东民众没有实现暴动的机会。因为，福建民众终于忍无可忍，聚起反抗；连福建官员也忍不下去了，一起弹劾高寀。朱翊钧难得相信一次地方官员，把高寀召回北京。然后呢？史书记载，高寀“不知所终”。什么意思？世人也不清楚，想来应该已经消亡于世的，尸骨无存。