在1645至1661年间，因为赋税管理制度的改革，丁口数从1000万增至1900万，约增加了90%。同时，从1651到1661年，登录在册的土地面积几乎翻了一番，从29亿亩增至约52.6亿亩，同时清朝政府的财政收入得以收支平衡，甚至颇有盈余。明朝中叶以来一直伴随着中央政府的财政危机在清朝时期得到了彻底的解决。
清朝政府还开辟了专门的部门处理水利事务，这个部门的负责人是王永吉。
王永吉在明朝晚期以专长于财政、刑法和灾荒赈济而声名卓著。
明朝水利系统早已经是混乱不堪。在清朝政府统治的前十年中，差不多每年都有河道大决口，造成严重水灾。在王永吉的领导和清朝政府的支持下，开始了大规模的修建水利工程。
清朝政府通过一系列的水利工程，如1686年修建冲鹤运河，1688年疏浚黄河口，1699年加固江苏高家堰堤坝。这些工程取得了很好的效果，在此后六十年内，黄河再也没有发生过一次大水灾，这对河北平原和淮阴地区的老百姓来说是造福无穷。
值得注意的是，清朝政府在政治、经济等改革措施上并非自己独创，相反，清朝政府的政治体制、中央机构，乃至改革方针，都是沿用了明朝时候的政策，甚至是改革的主要领导人也是明朝灭亡后投诚过来的叛臣，改革对于清朝政府来说好像没有明朝时期那么难，虽然在清朝入关后推行民族压迫政策，激起了大江南北的反抗，但是清朝的最终统一全国不是因为暴力镇压，而是因为积极的改革造成是不可否认的。
而明朝政府，以及南明政府，对他们而言，这些改革措施他们比清朝政府更有条件做到，他们完全可以得到民心，解决财政危机，提高军事实力，只不过他们都不屑、不愿去做罢了。
明之灭亡
明朝末年，“中国以土广民众，文化水准比较高的民族，但却为局处一隅的后金的野蛮民族的所击败”。此论有失偏颇，清之取国于李自成，而非明，这是南明政府和清朝政府的共识。
明末年间曾流传一首民谣。
“老天爷，你年纪大，耳又聋来眼又花。老天爷，你年纪大，你看不见人来听不见话。杀人放火的享受荣华，吃素看经的活活饿杀。杀人放火的享尽荣华，吃素看经的活活饿杀。老天爷，你不会做天，你塌了罢!老天爷，你不会做天，你不会做天，你