黄巢的副将尚让一再告谕市民说：“黄王起兵，本为百姓，非如李氏不爱汝曹，汝曹但安居无恐。”义军将士在街道上每遇到贫民，“往往施与之”，很有几分“黄巢来了不纳粮”的意思。
以至民间甚至编出“正月十五挂红灯”，“端午时节插艾草”的故事来褒颂黄巢和他的起义军。
但是，从广明元年(公元880年)十二月十二日，黄巢进入太清宫，并于翌日，在含元殿登上皇帝宝座，建国号“大齐”，建元为金统起，作为分界线，黄巢和他的起义军就此变质了。黄巢几乎全盘接收了唐末的政治制度和生活方式，封其妻为皇后，尚让、赵璋等为宰相，郑汉璋为御史中丞，皮日休为翰林学士，孟楷、盖洪等为尚书左、右仆射兼军容使。并下令：唐官三品以上全部停任，四品以下则官复原职。可见，大齐是由农民军文武官员与唐朝官员混合而成的一个政权机构。农民军憎恨官吏，对唐宗室、公卿士族实行严厉的镇压政策，“杀唐宗室在长安者无遗。”唐宰相及左仆射、右仆射、太子少师等藏匿民间，被义军搜出后“皆杀之”，连投降黄巢的左金吾大将军张直方因匿公卿于夹壁墙中，事发后亦被杀。黄巢这时露出了他“我花开后百花杀”血腥的峥嵘面目。他的起义军，则开始像强盗一样在长安街头杀人越货，抢男霸女。或许他们本来就是明火执仗，肆意妄为的强盗。在黄巢的统治下，老百姓连基本的农耕作业都已无法进行下去，相当一部分地区出现了“赤地千里”的景象。
随之而来，黄巢的本性也开始以一种极端的方式显露出来。有人题诗讥讽黄巢当了皇帝后，开始变得昏庸残暴。黄巢立刻组织人去查其作者，但是没有查出来，于是黄巢索性把长安城中三千多无辜的儒生砍了头;随着唐军的反攻，长安被唐军占领。但没几天又被黄巢夺了回来，对于长安的失而复得，黄巢却大光其火，他将之前的那次失利归罪于普通的长安平民，这个曾经被长安市民夹道欢迎的“率土大将军”，举起屠刀，血洗长安，将城中八万余名男丁杀戮殆尽。当黄巢于中和三年(公元883年)四月再次被赶出长安后，率部出蓝田入商洛山。五月，黄巢派左军中尉孟楷为先锋进攻蔡州(湖北枣阳)，唐节度使秦宗权战败后投降齐军，孟楷随即由蔡州移师转