因洁癖被打
起义将领张士诚的弟弟张士信，派人送来绢和金币求画。倪云林当场撕绢，说他不能为王门画师。由此得罪了张士信，后来张要杀他，经人说情，就打一顿鞭子。倪云林挨打时一声不吭。后来有人问他：“打得痛，叫一声也好!”倪云林竟说：“一出声，便俗了。”
死的郁闷
因为洁癖成命，别人利用他的洁癖整他。
后来有人抓他去坐牢，就故意把他绑在粪桶的旁边，令他痛不欲生。虽然生前洁癖的厉害，却是不洁而终。关于他的死有两种说法，但都是不洁的下场。一说倪云林临终前患痢疾，拉得满床都是，恶臭熏天，无人可以靠近；一说他是被朱元璋扔进粪坑淹死当然不排除另一种可能，那就是倪云林的洁癖和孤高，使他得罪了不少人，从而造他的谣，叫他死的不洁，这是洁癖成命的悲哀和下场。