1859年正月初五，叶名琛被掳到停泊在香港的英舰“无畏号”上。如此高官被俘，英国人倒也没有虐待他，而叶名琛自始至终也保持了一种凛然的气节。据《香港纪事报》载，军舰上所有军官很尊敬他。偶然有人上舰，都向叶脱帽致意，他也欠身脱帽还礼。他在军舰上生活了48天后，即被解往印度的加尔各答。
在印度，叶名琛以诗阐明自己的心迹：
“镇海楼头月色寒，将星翻作客星单。纵云一**中有，怎奈诸君壁上看。向戎何必求免死，苏卿无恙劝加餐。任他日把丹青绘，恨态愁容下笔难。”
诗中所效仿的人物，都是中国历史上具有民族气节的名人。一范即北宋范仲淹。向戎乃宋国的大夫，他在公元前546年发动弭兵运动，亲自劝说晋、楚、齐等13国在宋国首都会晤，此后列国间十多年没有战争。叶名琛自比向戎，是要说明自己不死而随英人走的目的。其中，苏武的自喻也是此种目的。
由此看来，叶名琛是把自己的被俘当成是可以觐见英国君主的契机。叶名琛后来对随他而去加尔各答的仆人明确地说明了这层意思：“我之所以不死而来者，当时闻夷人欲送我到英国。闻其国王素称明理，意欲得见该国王，当面理论，既经和好，何以无端起衅?究竟孰是孰非?以冀折服其心，而存国家体制。彼时此身已置诸度外，原欲始终其事，不意日望一日，总不能到他国，淹留此处，要生何为?所带粮食既完，何颜食外国之物!”
在加尔各答，叶名琛继续关注时事新闻，按时作息，清早即要人给他读报。后来，他得知觐见英国君王无望后，决定绝食。他于二月二十九日得病不食，至三月初七戌时病故。临终并无别话，只说辜负皇上天恩，死不瞑目。