对南怀仁的评价当然也有负面的，比如南怀仁制作的火炮多用于战场，所以受迫害的人或者一些不喜战争的人难免认为南怀仁的行为有所不当。但是更多的人则认为，当时清朝廷处于平定叛乱的重要时期，急需要各种强劲的武器，南怀仁不过是奉命打造武器，所以根本算不上什么。对南怀仁的评价有褒有贬，不过其中更多的还是赞扬，因为南怀仁对于天文以及武器方面的研究确实推进了当时社会的科技发展，这些是不能否定的。所以说，南怀仁的一生总的来说还是贡献比较多。
但总体而言，从中可以看出康熙都能知晓西方科技文化思想之利，但为了维护清朝的王朝统治，宁愿让中国落后西方数百年，也不愿引进西方思想文化科技。只想利用西方科技来平定国内内乱。
由此，我鄙视满清所有皇帝！
满清鞑虏！死不足惜！刨坟掘墓！理所应当！